情況之一：包莖及包皮過長
兩種畸形的包皮雖然都覆蓋陰莖，但是有包莖者其包皮不能翻至龜頭以上。新生兒的包皮與陰莖的粘連一般在出生後2～3年就可自然消失，這是一種正常的生理現象。包皮過長則只有用手將包皮上翻或當生殖器充分勃起，冠狀溝才能露出，平時則包攬整個龜頭。
情況之二：生殖器官短小
生殖器官先天性發育不良或外傷後部分斷離，從而造成生殖器官明顯短小，生理反應（即勃起時）達不到正常人長度者。生殖器官短小的人，其第二性征發育多較差，陰莖多存在勃起障礙，嚴重者甚至還有排尿困難。
情況之三：隱睪
一側或兩側睪丸未降入陰囊而停留於下降途中任何部位。在陰囊里找不到睪丸，就發生了隱睪癥。雙側隱睪可造成男性不育；單側隱睪也會影響生育能力，還易發生惡性病變。目前臨床上為方便診斷，把隱睪劃分為五個類型，即：睪丸下降不全型、睪丸發育不良型、垂體功能不全型、攣縮性睪丸以及睪丸異位。
情況之四：陰莖彎曲畸形
先天性陰莖彎曲是因陰莖海綿體發育障礙所引起的畸形，陰莖呈向股側彎曲。根據病變組織的部位與性質將先天性陰莖彎曲劃分為三類，即：尿道海綿體及其周圍筋膜缺如型、筋膜與白膜發育不良型和內膜發育不良型，其中以尿道海綿體缺如型的彎曲最為嚴重。本病病人的主要癥狀是陰莖彎曲，同時伴有排尿及性生活障礙。
